Les étés sont généralement longs, chauds, et humides avec St Louis ayant une moyenne maximum de 32°C et de minimum de 22°C en juillet. La température a Kansas City d’habitude atteint un maximum de 33°C et un minimum de 22°C pendant le même mois.
Les hivers sont d’habitude frais, mais rarement rudes. Les chutes de neige ont une moyenne 46 à 56 cm dans le Nord-Est et 20 à 30 cm dans le Sud-Est.
Missouri connaît beaucoup de pluie, avec une précipitation annuelle d’environ 91 cm dans le Nord-Ouest et de 119 cm dans le Sud-Est. Dans le Nord-Est, l’été est la saison des pluies tandis que le Sud-Est connaît la majorité de ses précipitations pendant les mois du printemps et d’automne.
Géographiquement, le Missouri peut être divisé en quatre régions: Les Plaines Découpées de Till (aussi connues comme les plaines glacées), les Plaines d’Osage, le Plateau d’Ozark et la Plaine Alluviale du Mississippi.
Les Plaines Découpées de Till comprennent toute la zone au Nord de la Rivière Missouri. Le paysage ondulé et les basses collines régulières de la région sont le résultat d’une érosion glaciaire. La terre est riche en minerais et idéal pour cultiver les produits agricoles comme le maïs.
Les Plaines d’Osage occupent un petit morceau triangulaire de prairie dans l’Ouest du Missouri (comprenant Kansas City). N’ayant jamais vu l’action glaciaire, cette région n’est pas aussi régulière ou aussi fertile que les Plaines Découpées du Till au Nord.
Le Plateau d’Ozark est la région la plus grande géographiquement qui occupe la moitié de la partie du Sud-Est de l’état. Vous y trouverez des régions montagneuses érodées, des collines aux contours déchiquetés, des vallées profondes et des lacs convolutés incluant le Lac d’Ozarks, grand de 15 km² (le plus grand lac du Missouri et une destination majeure pour les loisirs). L’état atteint son plus haut point dans cette région; les Montagnes de St François, un groupement de sommets et de dômes en granite, incluant le sommet le plus haut du Missouri, Taum Sauk (540 m). La région possède aussi plusieurs sources et grottes idéals pour le voyageur aventurier.
Le Plateau d’Ozark se vante de plus de 10 000 sources et au moins 1 450 grottes. Une des plus grandes grottes, Marvel Cave, près de Branson, s’étend sur près de 16 km en sous-sol et est la seule grotte dans le monde avec un chemin de fer qui y passe.
La Plaine Alluviale du Mississippi s’étend au Sud-Est à partir des villes de Cape Girardeau et Poplar Bluff. Cette région comprend la section du Missouri connue comme le 'boot heel' ('talon de la botte') à cause de sa forme. et fait partie de la basse Plaine Côtière du Golfe qui s’étend vers le nord a partir du Golfe du Mexique, traversant l’Illinois. Cette terre qui fut autrefois marécageuse fut asséchée et est maintenant une terre de culture fertile; mais elle est menacée chaque fois que le Mississippi déborde (la dernière grande inondation a eu lieu en 1993).
