Ce pays ne nécessite aucune vaccination.
L'hygiène au Japon est une priorité nationale. L'eau du robinet est propre à la consommation, les cas d'intoxication alimentaire sont rares, toutefois, méfiez-vous du poisson cru, surtout l'été quand il fait chaud, faites également attention si vous mangez du fugu, connu aussi sous le nom de poisson-globe, qui peut être mortel s'il n'est pas préparé correctement.
Cependant certains risques sont à prendre en considération, en tout premier lieu, les tremblements de terre. On enregistre environ trois secousses sismiques par jour au Japon, la plupart sont de très faible intensité, mais s'il s'agit d'une secousse importante, sortez immédiatement ou réfugiez-vous sous un porche pour vous protéger. Il y a quelques 200 volcans au Japon, dont certains sont actifs. La région autour du Mont Iwate est interdite au public depuis juillet 1998 par crainte d'une éruption. Le Mont Fuji, le plus célèbre sommet du Japon est un ancien volcan éteint.
Si vous allez vous promener dans la nature, méfiez-vous des serpents venimeux, comme le habu et le mamushi. En cas de morsure, essayez de ne pas bouger le membre touché et allez immédiatement à l'hôpital. Les coups de soleil sont aussi à craindre car la couche d'ozone est presque inexistante de nos jours. Il peut faire très chaud au Japon, emportez donc un bon écran total.
Si vous avez besoin d'une ambulance ou des pompiers, appelez le 199.
En cas d'urgence, composez le 110 pour appeler la police.
